Μετά την εμμηνόπαυση οι λειτουργικές κύστεις είναι σπάνιες, επειδή οι ωοθήκες σταματούν την παραγωγή ωαρίων και τα επίπεδα των ορμονών βρίσκονται πλέον σε χαμηλά επίπεδα. Εάν εντοπιστεί κύστη σε μία γυναίκα μετά την εμμηνόπαυση, είναι σημαντικό να γίνει λεπτομερής έλεγχος με υπερηχογράφημα και αιματολογικές εξετάσεις (καρκινικοί δείκτες), ώστε να αποκλειστεί το ενδεχόμενο κακοήθειας.